急性咽炎的病因:
（1）病毒感染 以柯萨奇病毒、腺病毒、副流感病毒引起者多见，鼻病毒及流感病毒次之，病毒多通过飞沫和亲密接触而传染。
（2）细菌感染 以链球菌、葡萄球菌和肺炎双球菌为主，其中以A组乙型链球菌引起者症状较重。若细菌或毒素进入血液，甚至发生远处器官的化脓性病变，称急性脓毒性咽炎。
（3）物理化学因素 如高温、粉尘、烟雾、刺激性气体等。
慢性咽炎的病因：
（1）局部因素
①急性咽炎反复发作转为慢性。
②上呼吸道慢性炎症刺激，如慢性鼻窦炎、鼻咽部炎症等，可因其炎性分泌物经后鼻孔流至咽后壁刺激粘膜，亦可因其使患者长期张口呼吸，引起粘膜过度干燥而导致慢性咽炎。另外，慢性扁桃体炎、龋齿等亦可引起慢性咽炎。
③长期烟酒过度，或受粉尘、有害气体的刺激，均可引起本病。
④职业因素(教师、歌唱者等)及体质因素亦可为本病诱因。
（2）全身因素
多种慢性病，如贫血、消化不良、反流性食管炎、心血管疾病、慢性下呼吸道炎症、肝肾疾病等都可引发本病。另外，内分泌紊乱、自主神经功能失调、维生素缺乏以及免疫功能紊乱等均与本病有关。
萎缩性咽炎的病因：
萎缩性咽炎常由萎缩性鼻炎蔓延而来，病因不明。
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